Еко-биотехнологија
Истраживања у области еко-биотехнологије су усмерена на развој еко-одрживих процеса заснованих на микроорганизмима и њиховом метаболичком потенцијалу, у циљу заштите и очувања животне средине. Група за еко-биотехнологију и развој лекова проучава биокаталитичка решења за санацију опасних и упорних загађивача, као и прераду пластичног отпада и конверзију у молекуле са додатом вредношћу, као што су биополимери, микробна наноцелулоза и биосурфактанти. Део истраживања се одвија у оквиру Хоризон Еуропе пројеката BioICEP и EcoPlastic.
Микроорганизми и окружење
Неколико група се бави идентификацијом и изолацијом микроорганизама из различитих срединских узорака, карактеризацијом њихових продуката и развијањем потенцијалних примена. Група за молекуларну микробиологију је фокусирана на примену бактеријских ензима и молекула за деградацију детерџената, у прехрамбеној индустрији за конзервацију хране и у процесима чишћења. Група за социомикробиологију проучава микробиом земљишта у циљу примене корисних микроорганизама као природних и вештачких конзорцијума, и њихових производа (малих молекула и ензима) у биоремедијацији, пољопривреди и медицини.
Медицинска биотехнологија
Истраживања у области медицинске биотехнологије су усмерена на сложене односе и процесе у микробним заједницама, са посебним фокусом на биофилмове. Група за социомикробиологију истражује мале молекуле у основи тих процеса, као што су екстрацелуларни сигнални молекули, секундарни метаболити и катаболички ензими, са циљем развоја нових антимикробних терапеутика, нових експерименталних модела, биомаркера за прецизнију/бржу дијагностику и лекова нове генерације.
Група за еко-биотехнологију и развој лекова проучава и оптимизује производњу микробних биоактивних секундарних метаболита кроз развој сојева и биопроцеса, и бави се њиховом структурном диверсификацијом применом биокатализе и зелене хемије.
Биотехнологија хране
Група за интеракцију пробиотика и микробиоте са домаћином проучава улогу микробиоте и пробиотика у стимулацији раста узгајаних риба и утицај микробиоте брашна и киселог теста на функционалне карактеристике хлеба. Лабораторија за молекуларну биологију биљака се бави проучавањем сложених молекуларних механизама који се активирају као одговор биљака на неповољне срединске услове, а који укључују више нивоа: генетички, биохемијски и метаболички.