Успостављање теста за молекуларну детекцију и патотипизацију вируса благог шаренила паприке (Pepper Mild Mottle virus)

Доказ концепта, Фонд за иновациону делатност Републике Србије, 5557, 2020-2021
Руководилац: Др Бојана Бановић Ђери
Учесници из ИМГГИ: Др Милена Угрин, Софија Нешић

Пројекат одговара на потребу за брзим и тачним приступом за молекуларну детекцију вируса благог шаренила паприке (енгл. „Pepper Mild Mottle virus“- PMMoV).  Имајући у виду да PMMoV умањује производњу паприке широм света, његово лако ширење и упорно присуство без могућности лечења, ефикасна детекција је од суштинске важности за наџор и контролу овог вируса. Тренутно доступне методе за надзор PMMoV детектују протеине вируса, одређене геномске регионе или биолошки одговор биљке, али нису поуздане, захтевне су у погледу времена и изводљивости и не могу детектовати различите патотипове у једној реакцији. Иновативни концепт пројекта нуди ефикасни и поуздани приступ надзору PMMoV који је заснован на претходно неискоришћеној могућности употребе „тихих“ мутација у вирусном геному за истовремено одређивање вирусног присуства и патогености. Тест ће таргетовати 8 мутација идентификованих у нашем претходно објављеном раду на специфичним PMMoV геномским позицијама. Овај пројекат ће испитати повезаност тих 8 таргет мутација са патотиповима нивоа 2 и 3, који су одговорни за >97% PMMoV инфекција. Уколико се докаже, предложени концепт ће омогућити поуздан и благовремен надзор PMMoV у земљи, води, фармама, пијацама, увозу/извозу семена/биљног материјала/хране/хранива, водећи повећаној безбедности хране и воде, са потенцијалом за комерцијализацију теста. Поред тога, оснажиће нова решења за борбу против PMMoV и других вируса.