Генска регулација у туморима

Група за генску регулацију у туморима се бави проучавањем структуре и функције регулаторних ДНК и РНК елемената и њиховом улогом у настанку и развоју малигних болести.

Главне теме истраживања су:

Алтернативни генски промотори - активност у различитом ћелијском и физиолошком контексту и интеракција са регулаторима транскрипције и малим РНК
Некодирајуће РНК - структура и функција, интеракциони партнери, експресија у различитом ћелијском и физиолошком контексту и улога у процесима релевантним за карциногенезу
5'-нетранслатирајући региони (5'-УТР) - профил експресије транскрипата са различитим 5’-УТР у различитом ћелијском и физиолошком контексту и интеракција са регулаторима транслације и микроРНК
Сигнални пут ТГФБ - структура и функција алтернативних промотора и 5'-УТР гена који кодирају учеснике сигналног пута, интеракција иРНК са микроРНК и карактеризација функционалних варијанти
Одговор на хемиорадиотерапију - карактеризација молекуларних механизама у основи комплетног патолошког одговора и хеморадиорезистенције

Фокус истраживања је на солидним туморима гастроинтестиналног тракта: колоректалном карциному, карциному панкреаса, хепатоцелуларном карциному и оралном карциному. Испитивања такође обухватају карцином плућа, карцином штитне жлезде и карцином јајника.

Истраживања се врше на 2Д и 3Д ћелијским културама и узорцима туморског и нетуморског ткива добијеним приликом ресекције тумора или биопсије. Посебна пажња је посвећена развоју модел система за ex vivo стимулацију туморског ткива у циљу испитивања механизама и детерминанти одговора на хемиорадиотерапију.

Поред класичних техника молекуларне и ћелијске биологије у раду се користе савремени биоинформатички приступи и методе великог обухвата нове генерације - транскриптомика и протеомика.

У рад су укључени студенти свих нивоа студија кроз реализацију семинарских и научно-истраживачких радова.

Иновационе активности су усмерене на испитивање потенцијала регулаторних ДНК и РНК елемената као биосензора, биомаркера и терапијских мета у малигним болестима.

Александра Николић

Научни саветник

Група за генску регулацију у туморима
Департман за хуману молекуларну генетику и геномику

aleksandra.nikolic@imgge.bg.ac.rs

Др Александра Николић је научни саветник и руководилац Групе за генску регулацију у туморима. У ИМГГИ је запослена од 2002. године, а од 2024. је ангажована и као координатор Канцеларије за управљање и подршку пројектима.

Бави се проучавањем поремећаја транскрипционе регулације у солидним туморима са фокусом на туморе гастроинтестиналног тракта. Њена истраживања су усмерена на идентификацију регулаторних елемената ДНК и РНК који се специфично понашају у малигној ћелији са идејом да могу послужити као биомаркери или биосензори, као и за развој циљаних терапија за малигне болести. Руководила је пројектом SENSOGENE у склопу програма ПРОМИС Фонда за науку кроз који је у своја истраживања увела рад на 3Д ћелијским културама и биоинформатичке приступе. Посебно је заинтересована за мултидисциплинарне сарадње које би омогућиле напредне анализе и бољу искоришћеност доступних транскриптомских и протеомских података, развој биомаркера и биосензора као дијагностичких алата за примену у клиничком окружењу, као и развој нове генерације терапеутика на бази молекула РНК.

Интензивно се бави научном едукацијом и комуникацијом и на овом плану сарађује са великим бројем средњих школа, центрима за теленте, ИС Петница и студентским удружењима. Била је ментор 5 докторских дисертација, 9 мастер радова и 11 дипломских радова, као и супервизор пракси и студентских радова више од 100 студената основних студија. Од 2011. године је руководилац Програма биологије и хемије за средњошколце. Реализатор је већег броја едукација и радионица у области академских вештина, а на Биолошком факултету је од 2017. гост-предавач на овом предмету. Учествовала је у свим пројектима које је ИМГГИ реализовао у склопу програма Ноћ истраживача Европске комисије и била је руководилац два оваква пројекта, SCIMFONICOM И SCIMFONICOM 2.013. Креирала је "Игру каријерног развоја" (издања за средњошколце, студенте и докторанде) која је намењена упознавању са изазовима рада у науци на забаван начин прилагођен узрасту.

Програм рада ИМГГИ за 2025. годину - Министарство науке, технолошког развоја и иновација Републике Србије, 451-03-136/2025-03/200042, 2025

Worm Profiler: Surveillance and population genetics of Echinococcus in Serbia (WORM_PROFILER) (2024-2026)

Live RNA imaging and knockdown using programmable CRISPR-Cas13 (LiveRNA)

НАУЧНИ САВЕТНИЦИ

Јованка Лукић

ВИШИ НАУЧНИ САРАДНИЦИ

НАУЧНИ САРАДНИЦИ

ИСТРАЖИВАЧИ САРАДНИЦИ

Дуња Павловић

ИСТРАЖИВАЧИ ПРИПРАВНИЦИ

Анастасија Бубања

Кључне публикације

Babic T, Banovic Djeri B, Pavlovic D, Dragicevic S, Despotovic J, Karanovic J, Nikolic A. Comparative RNA-Seq Analysis of Colon Spheroids and Patient-derived Tissues Identifies Non-Canonical Transcript Isoforms of Protein-Coding Genes Implicated in Colon Carcinogenesis. Cancer Inform. 2025 Nov 24;24:11769351251396250. doi: 10.1177/11769351251396250.
Pavlovic D, Babic T, Ignjatovic S, Pavlovic K, Dragicevic S, Nikolic A. Transcript PHF19-207 May Be a Long Non-Coding RNA with Tumor-Promoting Role in Colon Cancer. Biomolecules. 2025;15(7):957. doi: 10.3390/biom15070957.
Dragicevic S, Dinic J, Ugrin M, Vidovic M, Babic T, Nikolic A. Transcriptomic Landscape of Paclitaxel-Induced Multidrug Resistance in 3D Cultures of Colon Cancer Cell Line DLD1. Int J Mol Sci. 2025;26(14):6580. doi: 10.3390/ijms26146580.
Babic T, Ugrin M, Jeremic S, Kojic M, Dinic J, Banovic Djeri B, Zoidakis J, Nikolic A. Dysregulation of transcripts SMAD4-209 and SMAD4-213 and their respective promoters in colon cancer cell lines. J Cancer. 2024;15(15):5118-5131. doi: 10.7150/jca.98911.
Babic T, Lygirou V, Rosic J, Miladinov M, Rom AD, Baira E, Stroggilos R, Pappa E, Zoidakis J, Krivokapic Z, Nikolic A. Pilot proteomic study of locally advanced rectal cancer before and after neoadjuvant chemoradiotherapy indicates high metabolic activity in non-responders' tumor tissue. Proteomics Clin Appl. 2023;17(1):e2100116. doi: 10.1002/prca.202100116.

Публикације