Uspostavljanje testa za molekularnu detekciju i patotipizaciju virusa blagog šarenila paprike (Pepper Mild Mottle virus)

Dokaz koncepta, Fond za inovacionu delatnost Republike Srbije, 5557, 2020-2021
Rukovodilac: Dr Bojana Banović Đeri
Učesnici iz IMGGI: Dr Milena Ugrin, Sofija Nešić

Projekat odgovara na potrebu za brzim i tačnim pristupom za molekularnu detekciju virusa blagog šarenila paprike (engl. „Pepper Mild Mottle virus“- PMMoV).  Imajući u vidu da PMMoV umanjuje proizvodnju paprike širom sveta, njegovo lako širenje i uporno prisustvo bez mogućnosti lečenja, efikasna detekcija je od suštinske važnosti za nadzor i kontrolu ovog virusa. Trenutno dostupne metode za nadzor PMMoV detektuju proteine virusa, određene genomske regione ili biološki odgovor biljke, ali nisu pouzdane, zahtevne su u pogledu vremena i izvodljivosti i ne mogu detektovati različite patotipove u jednoj reakciji. Inovativni koncept projekta nudi efikasni i pouzdani pristup nadzoru PMMoV koji je zasnovan na prethodno neiskorišćenoj mogućnosti upotrebe „tihih“ mutacija u virusnom genomu za istovremeno određivanje virusnog prisustva i patogenosti. Test će targetovati 8 mutacija identifikovanih u našem prethodno objavljenom radu na specifičnim PMMoV genomskim pozicijama. Ovaj projekat će ispitati povezanost tih 8 target mutacija sa patotipovima nivoa 2 i 3, koji su odgovorni za >97% PMMoV infekcija. Ukoliko se dokaže, predloženi koncept će omogućiti pouzdan i blagovremen nadzor PMMoV u zemlji, vodi, farmama, pijacama, uvozu/izvozu semena/biljnog materijala/hrane/hraniva, vodeći povećanoj bezbednosti hrane i vode, sa potencijalom za komercijalizaciju testa. Pored toga, osnažiće nova rešenja za borbu protiv PMMoV i drugih virusa.