Mikroskopi su optički instrumenti sa funkcijom uveličanja uzoraka koji su suviše mali da bi se videli golim okom.

Institut poseduje mikroskope napredne generacije za svetlosnu mikroskopiju (stereo mikroskop, mikroskope sa svetlim vidnim poljem, konfokalni, fluorescentni i fazno kontrastne mikroskope) opremljene CCD kamerama i softverima za analizu.

U Institutu se ovi uređaji koriste za generisanje visoko kvalitetnih mikrografija poreklom od različitih uzoraka (hromozomi, fiksirane ćelije i preseci tkiva, žive ćelije i organizmi) u cilju unapređenja osnovnih i primenjenih istraživanja.